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Posti tesi - Join us

Stiamo costantemente cercando studenti motivati e iscritti ai corsi di laurea in Scienze Biologiche, Biotecnologie o Informatica per lo svolgimento di tesi/tirocinio presso il nostro gruppo di lavoro. Per informazioni sui progetti disponibili cliccare qui. Contatti: Renato FaniMarco BazzicalupoAlessio Mengoni, Marco Fondi


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Martedý, 22 Novembre 2011 - 14:28 Stampa la notizia: Posti tesi - Join us
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Bosi E, Donati B, Galardini M, Brunetti S, Sagot MF, Lió P, Crescenzi P, Fani R, Fondi M. MeDuSa: a multi-draft based scaffolder. Bioinformatics. 2015 Mar 25. PubMed PMID: 25810435. http://combo.dbe.unifi.it/medusa

Mengoni, Alessio, Galardini, Marco, Fondi, Marco (Eds.) Bacterial Pangenomics, Methods and Protocols, Springer ISBN 978-1-4939-1719-8 

Bacci G, Bani A, Bazzicalupo M, Ceccherini MT, Galardini M, Nannipieri P,Pietramellara G, Mengoni A. Evaluation of the Performances of Ribosomal Database Project (RDP) Classifier for Taxonomic Assignment of 16S rRNA Metabarcoding sequences Generated from Illumina-Solexa NGS. J Genomics. 2015 Feb 1;3:36-9. doi:10.7150/jgen.9204. PubMed PMID: 25653722; 

Bacci G, Ceccherini MT, Bani A, Bazzicalupo M, Castaldini M, Galardini M,Giovannetti L, Mocali S, Pastorelli R, Pantani OL, Arfaioli P, Pietramellara G,Viti C, Nannipieri P, Mengoni A. Exploring the dynamics of bacterial community composition in soil: the pan-bacteriome approach. Antonie Van Leeuwenhoek. 2015 Mar;107(3):785-97. doi: 10.1007/s10482-014-0372-4. PubMed PMID:25563635.

Mori G, Chiarelli LR, Esposito M, Makarov V, Bellinzoni M, Hartkoorn RC, Degiacomi G, Boldrin F, Ekins S, de Jesus Lopes Ribeiro AL, Marino LB, Centárová I, Svetlíková Z, Blaško J, Kazakova E, Lepioshkin A, Barilone N, Zanoni G, Porta A, Fondi M, Fani R, Baulard AR, Mikušová K, Alzari PM, Manganelli R, de Carvalho LP, Riccardi G, Cole ST, Pasca MR. Thiophenecarboxamide Derivatives Activated by EthA Kill Mycobacterium tuberculosis by Inhibiting the CTP Synthetase PyrG. Chem Biol. 2015 Jun 18. doi: 10.1016/j.chembiol.2015.05.016. PubMed PMID: 26097035.

Andreani NA, Carraro L, Martino ME, Fondi M, Fasolato L, Miotto G, Magro M, Vianello F, Cardazzo B. A genomic and transcriptomic approach to investigate the blue pigment phenotype in Pseudomonas fluorescens. Int J Food Microbiol. 2015 Jun 1. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2015.05.024.  PubMed PMID: 26051958

Fondi M, Maida I, Perrin E, Mellera A, Mocali S, Parrilli E, Tutino ML, Liò P, Fani R. Genome-scale metabolic reconstruction and constraint-based modelling of the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125. Environ Microbiol. 2014 May 28. doi: 10.1111/1462-2920.12513. PubMed PMID:24889559. 

Galardini M, Mengoni A, Biondi EG, Semeraro R, Florio A, Bazzicalupo M, Benedetti A, Mocali S. DuctApe: a suite for the analysis and correlation of Genomic and OmniLog<sup>TM</sup> Phenotype Microarray data. Genomics. 2014 Jan;103(1):1-10. doi: 10.1016/j.ygeno.2013.11.005.  PubMed PMID: 24316132.

Fondi M, Liò P Multi -omics and metabolic modelling pipelines: challenges and tools for systems microbiology. Microbiol Res. 2015 Feb;171:52-64. doi: 10.1016/j.micres.2015.01.003. PubMed ID 25644953

Orlandini V, Emiliani G, Fondi M, Maida I, Perrin E, Fani R. Network Analysis of Plasmidomes: The Azospirillum brasilense Sp245 Case. Int J Evol Biol. 2014;2014:951035. doi: 10.1155/2014/951035. Epub 2014 Dec 29. PubMed ID 25610702

Spagnoletti M, Ceccarelli D, Rieux A, Fondi M, Taviani E, Fani R, Colombo MM, Colwell RR, Balloux F. Acquisition and evolution of SXT-R391 integrative conjugative elements in the seventh-pandemic Vibrio cholerae lineage. MBio. 2014 Aug 19;5(4). doi: 10.1128/mBio.01356-14. PubMed ID 25139901

Fondi M, Orlandini V, Corti G, Severgnini M, Galardini M, Pietrelli A, Fuligni F, Iacono M, Rizzi E, De Bellis G, Fani R. Enly: Improving Draft Genomes through Reads Recycling. J Genomics. 2014 Apr 5;2:89-93. doi: 10.7150/jgen.7298. PubMed ID: 25031660

 



Martedý, 22 Novembre 2011 - 11:16 Stampa la notizia: Last publications!
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